Ziemia płonie. Rasa przerażających maszyn, które atakują ze znanych miejsc, rozpoczęła niszczenie rasy ludzkiej. Gracz przejmuje kontrolę nad komandorem Shepardem, którego zadaniem jest uratowanie ludzkości i zjednoczenie cywilizacji galaktyki. Wyrusza on na ostatnią misję, aby odzyskać planetę Ziemię.
[Zaktualizowano - platformy docelowe] Czy komandor Shepard zdoła uratować Ziemię w finalnej części trylogii Mass Effect? Odpowiedź na to pytanie poznamy w okresie świątecznym 2011, kiedy to gra trafi do sklepów.